1993年7月20日，随着开发开放浦东的国家战略深入推进，上海市浦东新区工会工作委员在浦东新区上海船厂挂牌运转，作为上海市总工会派出机构，受中共浦东新区党工委领导。2001年7月，根据上海市浦东新区建政要求，上海市浦东新区总工会正式成立。2009年8月，原浦东新区总工会和南汇区总工会合署办公。10月选举成立新一届总工会领导机构。
浦东新区总工会从初创伊始就面临着不一般的挑战。在区委和市总工会的领导下，在广大职工的参与、理解和支持下，在新区各级工会不懈的工作和努力下，浦东新区总工会坚持开门办会、依法治会、民主兴会、事业强会，探索并形成了具有浦东特色、时代特征的浦东工会工作新格局。
创新工会组织建设
浦东新区总工会本着“哪里有企业、哪里有职工，哪里就有工会组织”的原则，不断加强依法建会的力度。
初期，创造了具有浦东特点的五种行之有效的建会模式。一是以新区各大开发公司为龙头的开发区域工会联合会模式；二是城市化地区按街坊小区建会的“梅园模式”；三是农村化地区以行政村为依托的“三林模式”；四是陆家嘴地区以大厦为载体的“大楼模式”；五是商贸集市中以个体劳动者为对象的“集市模式”，努力实现最大限度地将广大职工组织到工会中来的目标和追求。
近年来，创新工会组织体制。探索建立开发区总工会体制，先后在陆家嘴金融贸易区、张江高科技园区、金桥经济技术开发园区、康桥工业园区和南汇工业园区成立开发区总工会，秉承去行政化、去机关化、去封闭化的理念，将原有的“管理架构”转变为“服务架构”，打造开发区工会升级版。健全直属工会的“小三级”组织体系，推动街镇、开发区工会对企业工会的工作覆盖、服务覆盖和活动覆盖，基层工会组织数100个以上的直属工会都建立了三级组织网络。探索建立非公企业兼职工会岗位津贴制度，探索建立权益维护专项机制，推动工会主席在企业工会履行职能中发挥主导作用，实现基层工会换届率和工会主席直选率98%。
全面履行各项社会职能
浦东新区总工会始终把服从服务于经济社会发展大局作为根本任务，凝聚人心、激发干劲，积极引领全区职工在浦东开发开放中担当主力、发挥作用。
注重引领职工创新推动发展，适应建设创新浦东的要求。打造浦东工会职工科技创新品牌。设立每年400万元职工科技创新专项资金，连续八年开展科技创新、合理化建议、先进操作法和科技英才、工人发明家等五个项目的评比，近三年申报项目和个人累计达到2839项，创造经济效益400多亿元，切实促进群众性科技创新成果转化。培育61家劳模创新工作室、60家职工科技创新基地。
首批开展“促进区域发展”全国示范性劳动竞赛。根据浦东发展战略和生产力布局，先后设立了金融贸易、航运物流、迪士尼等分赛区，首创非公企业“契约化”劳动竞赛，推动劳动竞赛跨体制、跨区域、跨行业，成为企业与职工共同发展的重要推动力，促进推动浦东创新驱动、转型发展。
践行社会主义核心价值观，共筑中国梦。早在2010年，作为全市工会系统唯一一家直接参与世博志愿服务保障的区级工会，发挥组织网络优势，在世博期间实现了130个志愿服务内设站有序运行，13万人次职工志愿者坚守岗位，提供各类服务300万人次。之后，职工志愿服务形成制度化，每月开展职工志愿服务专场，累计服务人次超过20万人。着力打造职工职业道德“双十佳”评选、“南腔北调”职工文化品牌，“浦东职工”微博、“粉领驿站”微信等新媒体，引导职工践行社会主义核心价值观，为实现中华民族伟大复兴的中国梦凝聚共识。
突出依法**基本职责
浦东新区总工会把**维稳作为天职，以体制机制的不断创新，推动难点重点的突破，努力构建和谐稳定的劳动关系，促进和谐社会建设。
着力强化源头**。指导企业工会开展平等协商，签订集体合同及工资和女职工专项集体合同；加强职代会制度建设，大力推进厂务公开民主管理建设，深化国有企事业职工代表大会报告制度，在外资和民营等非公企业中，深入推进“2＋X”民主管理模式，扩大职代会在非公企业中的覆盖率；定期召开劳动关系三方联席会议，开展劳动关系和谐企业和诚信企业创建活动，促进企业建立和谐稳定的劳动关系等。
建成职工法律援助体系。以职工“就近**、及时**、高效**”为目标，搭建了"1+6+N"职工法律援助体系，做强做实新区职工法律援助中心建设。2014年，共接待法律咨询4649件、6807人次；受理并代理仲裁、诉讼377件、507人次。
关心关爱各类职工群体。项目化推进帮困关爱、高温慰问、“五·一”主题服务活动等传统工作，形成区总、直属工会、基层工会纵向三级联动的工作格局，实现投入经费、可用资源和受惠职工的最大化。仅2015年元旦春节期间，全区各级工会投入帮困送温暖资金3300万余元，受惠职工7.3万人次。2014年高温期间，各级工会投入资金及实物计1.9亿元，慰问职工近80万人。10年来累计为20万余名外来建设者提供免费健康体检。近三年来布点爱心妈咪小屋48家，为职业女性营造职场休憩站。推出“幸福四叶草”主题工程，多维度、系统性地提升女职工职场幸福力和生活幸福感。
